Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Paket >> ecne (12.0LTS) >> python >> python3-pyspoa
[  aramo  ] [  ecne  ] [  xolotl  ]
[ Källkod: python-pyspoa  ]

Paket: python3-pyspoa (0.0.10-1build2)

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

Andra paket besläktade med python3-pyspoa

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • dep: libc6 (>= 2.32)
    GNU C Library: Shared libraries
    också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ej armhf, riscv64]
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5) [amd64]
    SIMD partial order alignment library
    dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [ej amd64]
  • dep: libstdc++6 (>= 13.1)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: python3 (<< 3.13)
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (>= 3.12~)

Hämta python3-pyspoa

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
amd64 55,1 kbyte149 kbyte [filförteckning]
arm64 51,3 kbyte149 kbyte [filförteckning]
armhf 49,3 kbyte100 kbyte [filförteckning]
ppc64el 58,7 kbyte213 kbyte [filförteckning]
riscv64 56,1 kbyte125 kbyte [filförteckning]